Đảng bộ Tập đoàn Phúc Lộc được thành lập từ năm 2014 trên cơ sở sáp nhập Đảng bộ Công ty cổ phần Dược phẩm Ninh Bình, Chi bộ Công ty cổ phần Giống bò thịt, sữa Yên Phú và Chi bộ Công ty cổ phần Phúc Lộc. Thời gian qua, bám sát chức năng, nhiệm vụ, Đảng ủy Tập đoàn đã phối hợp chặt chẽ với lãnh đạo Tập đoàn để phát động các phong trào thi đua lao động sản xuất, phát huy tinh thần làm chủ, năng động, sáng tạo của cán bộ, đảng viên, công nhân, góp phần hoàn thành các mục tiêu sản xuất, kinh doanh, nâng cao đời sống vật chất, tinh thần cho người lao động, khẳng định vị trí của tổ chức Đảng trong đơn vị.